Protocolo para una revisión sistemática para evaluar el papel de los cultivos virales para la evaluación de la transmisión aérea de SARS-CoV-2

En un artículo reciente publicado en medRxiv* Servidor de preimpresión Los investigadores proporcionan un protocolo de revisión sistemática para evaluar cultivos virales para la transmisión aérea del síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2).

estancia: Cultivos virales para evaluar la transmisión aérea de SARs-CoV-2: un protocolo de revisión sistemática (Versión 1).. Haber de imagen: Design_Cells/Shutterstock

La propagación de gotitas respiratorias que contienen microorganismos infecciosos, que permanecen infecciosos cuando están suspendidas en el aire durante mucho tiempo y distancia, conduce a la transmisión de un agente infeccioso a través del aire. Dado el impacto global generalizado de la pandemia de coronavirus 2019 (COVID-19) en curso y la alta susceptibilidad de las nuevas variantes del SARS-CoV-2, existe una necesidad urgente de evidencia sólida de transmisión aérea del SARS-CoV-2.

Revisiones sistemáticas anteriores

Los investigadores del estudio actual realizaron recientemente una revisión sistemática de 67 estudios primarios y 22 revisiones sobre el transporte aéreo del SARS-CoV-2 para identificar, evaluar y resumir la evidencia de esto.

Los estudios incluidos fueron de baja calidad, carecían de técnicas estandarizadas y eran observacionales. Se intentó un total de 10 estudios de cultivo viral, pero no se logró sacar ninguna conclusión firme debido a la falta de SARS-CoV-2 recuperable en los cultivos. Las revisiones restantes indicaron una falta de evidencia para respaldar la transmisión aérea del SARS-CoV-2. La mayoría de los estudios iniciales identificaron el ARN del SARS-CoV-2 en el aire, pero no lograron detectar el virus SARS-CoV-2 infeccioso.

Luego, los investigadores realizaron una revisión sistemática que evaluó la transmisión y el potencial de transmisión para pacientes asintomáticos con SARS-CoV-2. Esta revisión utilizó datos de estudios con cultivos virales, valores umbral del ciclo de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y secuenciación de genes. A partir de estos estudios de alta calidad se obtuvo posible evidencia sobre la transmisión del SARS-CoV-2 de pacientes asintomáticos o presintomáticos, junto con información adicional de los autores de estos estudios.

Poco después de la publicación de esta revisión sistemática, se publicaron varios estudios nuevos dirigidos a la transmisión aérea del SARS-CoV-2. Además, la revisión también derivó en un marco para obtener pruebas sólidas con respecto a la transmisión de agentes respiratorios infecciosos.

Marco para futuras revisiones sistemáticas

En el futuro, los investigadores planean realizar una revisión sistemática para evaluar la evidencia de transmisión aérea del SARS-CoV-2 a partir de estudios de alta calidad que confirmen la infección mediante PCR longitudinal o cultivos virales con o sin secuenciación genética. Esta investigación tiene como objetivo determinar si las muestras de SARS-CoV-2 en el aire son infecciosas. En caso afirmativo, los investigadores planean evaluar además la proporción de SARS-CoV-2 requerida para ser infeccioso en el aire, el tiempo y la distancia que permanece infeccioso en el aire, y la relación entre los valores de PCR ct en el aire y la infección de la muestra. es decir, casos de transmisión en cadena que proporcionan evidencia real de transmisión del SARS -CoV-2 está en el aire, las condiciones requeridas para que el SARS-CoV-2 permanezca infeccioso en el aire a largas distancias.

Solo se incluirán en la revisión sistemática los estudios con transcriptasa inversa-PCR cuantitativa en serie (qRT-PCR), o cultivo viral, con o sin secuenciación genética, mientras que se excluirán los estudios de modelado o predictivos.

Se planea una búsqueda impulsada por especialistas en información de medRxiv, LitCovid, la Organización Mundial de la Salud (OMS) COVID-19 y Google Scholar usando palabras clave como aerotransportados, aerosoles y gotitas del 10 de septiembre de 2020 al 30 de diciembre de 2021 para actualizar el resultados de revisiones anteriores.

La extracción de variables se basará en un modelo estándar para la extracción y evaluación de datos. Los datos extraídos incluirán el tipo de estudio, los métodos de muestreo, la configuración del estudio y las características de la población.

Además, dos revisores determinarán por separado la elegibilidad de los estudios para su inclusión en el análisis. Si la discusión entre los revisores no puede resolver las diferencias de opinión, un tercer revisor decidirá el asunto.

Los investigadores planean usar técnicas de su revisión anterior en pacientes con SARS-CoV-2 asintomáticos y asintomáticos para determinar la cadena de transmisión del SARS-CoV-2. Según la revisión anterior, los estudios elegibles fueron aquellos con potencial documentado para la transmisión presintomática y asintomática de SARS-CoV-2, monitoreo e informe adecuados de los síntomas de SARS-CoV-2 y detección de SARS-CoV-2 infeccioso a partir de virus. cultura.

Para determinar la calidad de los estudios incluidos, los investigadores pretenden caracterizar la fuente de población, los métodos de estudio, las muestras de SARS-CoV-2, los informes de resultados y la vigilancia.

La revisión sistemática se realizará de acuerdo con los términos de informe preferidos para las revisiones sistemáticas y las Directrices PRISMA. Si los datos lo permiten, también se realizan análisis descriptivos y análisis de subgrupos.

*Nota IMPORTANTE

medRxiv publica informes científicos preliminares que no están sujetos a revisión por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica/comportamiento relacionado con la salud ni tratarse como información establecida.