Un enfoque de minería de datos para revelar señales asociadas con secuelas pediátricas graves de COVID-19

En un estudio reciente publicado en medRxiv*Preimpresión del servidor Los investigadores describen estadísticas de encuestas basadas en árboles para la enfermedad pediátrica por coronavirus a largo plazo 2019 (COVID-19).

antecedentes

Los Institutos Nacionales de Salud (NIH) iniciaron la iniciativa Investigación para mejorar la recuperación (RECOVER) de COVID-19 en 2021 con el fin de utilizar datos de registros de salud electrónicos (EHR) para identificar y clasificar a los pacientes con consecuencias post-agudas de COVID-19 (PASC). ), según lo descrito por los institutos El Servicio Nacional de Salud define la incapacidad de recuperarse de la infección por SARS-CoV-2 o la persistencia de los síntomas durante más de 30 días.

Según la literatura científica, se ha predicho PASC en pacientes infectados con COVID-19 y se ha descrito su origen, factores de riesgo y evolución. Hasta la fecha, solo unos pocos estudios han descrito con precisión PASC entre los niños.

sobre estudiar

En este estudio, los investigadores intentaron detectar señales de PASC mediante la extracción de datos en lugar de la experiencia clínica.

Dos comparaciones dominaron los análisis presentados. Los casos de PASC se compararon con los infectados, el síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2) y los pacientes no infectados. Los manuales de PASC incluían el código de diagnóstico U09.9, una terminología de interfaz EHR (IMO) que contenía las cadenas («post», «agudo» y «covid»), o el código de diagnóstico B94.8.

Los pacientes infectados tuvieron una prueba de reacción en cadena de la polimerasa (PCR), antígeno o serología positiva para SARS-COV-2. Las pruebas serológicas para la infección incluyeron inmunoglobulina (Ig)-M, anticuerpos IgG anti-nucleocápside (N), anticuerpos IgG anti-spiking (S) o dominio de unión al receptor (RBD) y anticuerpos IgA e IgG indiferenciados. Los pacientes con COVID-19 en un hospital o departamento de emergencias (SU) también se clasificaron como portadores de SARS-CoV-2.

Durante el período de observación del estudio, las pruebas de virus todavía eran comunes en los entornos de atención médica. Se consideró que los pacientes no estaban infectados con SARS-CoV-2 si (1) todas las pruebas de diagnóstico, como antígeno, PCR y serología, fueron negativas durante el período de estudio, y (2) el paciente no tenía códigos de diagnóstico que indicaran COVID-19, el síndrome inflamatorio multisistémico en niños (MIS-C), o PASC.

La fecha de entrada en la cohorte para incidencias de infección por PASC fue la misma fecha que la prueba de antígeno inicial positiva o la prueba de PCR, cuatro semanas antes de la prueba serológica inicial positiva.Y el o cuatro semanas antes del diagnóstico inicial de PASC en ausencia de pruebas de confirmación.

La fecha de admisión para pacientes sin COVID-19 se basó en el primer diagnóstico o exposición a COVID-19. Para los pacientes no infectados con SARS-CoV-2, las pruebas negativas aleatorias se anotaron como fechas de ingreso a la cohorte. Al ingreso a la cohorte, todos los pacientes de casos y controles tenían más de 21 años de edad. Para cada diagnóstico y código de paciente, el equipo generó un índice binario de la ocurrencia del incidente dentro de los 28 a 179 días posteriores a la admisión al grupo.

El equipo utilizó la Clasificación Internacional de Enfermedades, Décima Revisión (ICD-10) como entrada. La jerarquía seguida tenía siete niveles de nodos correspondientes a cada nivel del árbol de exploración. La jerarquía se denominó alternativamente como un árbol, mientras que el grupo que contenía el nodo a junto con sus descendientes se denominó rama de árbol o fragmentos.

consecuencias

Se reclutaron un total de 13.750 pacientes para las tres categorías entre el 1 de marzo de 2020 y el 22 de junio de 2022, con 1.250 casos de infección. Los niños y niñas más pequeños tenían menos probabilidades de unirse al grupo PASC. La mayoría de los grupos ingresaron en el otoño de 2021.

Surgieron múltiples indicadores estadísticos cuando se compararon personas con PASC y COVID-19. En la encuesta de árbol de más alto nivel, se observaron heridas anotadas con códigos ICD-10 para signos, síntomas, hallazgos clínicos y de laboratorio no clasificados en otra parte, enfermedades musculoesqueléticas y del tejido conectivo, trastornos del sistema nervioso, trastornos respiratorios y trastornos mentales. trastornos del comportamiento, nutricionales, endocrinos y metabólicos, enfermedades circulatorias, variables que afectan el estado de salud y los servicios de salud, enfermedades de la piel y tejido subcutáneo; y enfermedades del tracto gastrointestinal.

Dentro de la rama que describe signos y síntomas no clasificados, las tres lesiones principales corresponden a síntomas respiratorios y circulatorios, síntomas generales y síntomas cognitivos, emocionales y conductuales.

conclusión

Los resultados del estudio mostraron varios trastornos y sistemas corporales asociados con PASC. Dado que el estudio utilizó métodos basados ​​en datos, el equipo identificó muchas enfermedades y síntomas nuevos o no informados.

Los investigadores creen que se requiere un enfoque basado en datos para el descubrimiento de conocimientos debido a la naturaleza rápidamente cambiante de la pandemia y la falta de acuerdo sobre los síntomas exactos que caracterizan a PASC en los niños. Este análisis integral de los diagnósticos en una cohorte de niños con PASC agrega mucho al conocimiento de la comunidad médica sobre los síntomas complejos de este trastorno.

Los resultados del estudio pueden guiar el diseño de futuros estudios prospectivos para explorar más a fondo los patrones encontrados aquí, mejorar la práctica terapéutica y centrar la investigación en los fundamentos bioquímicos de PASC.

*Nota IMPORTANTE

medRxiv publica informes científicos preliminares que no son revisados ​​por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, dirigir la práctica clínica o el comportamiento relacionado con la salud, ni tratarse como información sólida.