¿Qué son 677 mutaciones? Se han encontrado nuevas variantes de Covid-19 en los Estados Unidos

La variación aleatoria es un componente esencial de todos los seres vivos. Impulsa la diversidad, por eso hay tantos tipos diferentes. Los virus no son una excepción. La mayoría de los virus son expertos en alterar sus genomas para adaptarse a su entorno. Ahora tenemos evidencia de que el virus que causa Covid, SARS-CoV-2, no solo está mutando, sino que está cambiando de manera importante. Este es el decimosexto de una serie de artículos sobre cómo está cambiando el virus y qué significa para la humanidad. Leer el resto: parte unoY el la segunda parteY el la tercera parteY el cuarta parteY el Parte quintaY el Parte VIY el Parte sieteY el Parte 8Y el Parte 9Y el Parte 10Y el Parte 11Y el Parte 12Y el Parte 13Y el Parte 14, Y el Parte quince.

Este invierno, nuevos tipos de SARS-CoV-2 han arrasado al mundo. Aparecieron en rincones del mundo tan diversos como Brasil y Reino Unido; Exhibía una serie de propiedades nuevas y preocupantes, que iban desde una mayor transmisibilidad hasta la inmunidad; Realizamos nuestros mejores esfuerzos para mitigar colectivamente la propagación de Covid-19 a través de medidas de salud pública y vacunas. A principios de esta semana escribí un archivo Pedazo Detalla por qué esta tendencia es tan preocupante para Estados Unidos, ya que se han identificado variables preocupantes en países como Ohio Y el California Pero permanece relativamente bajo el radar y se transmite sin el conocimiento de la mayoría de los estadounidenses. En el episodio de hoy, quiero centrarme en la manifestación reciente de lo que los investigadores denominan variantes 677, que son un grupo de cepas que, al menos por el momento, parecen confinadas únicamente a los Estados Unidos.

La característica definitoria de la diversidad viral es que pequeñas modificaciones que distinguen una variante de otra pueden surgir en sitios separados al mismo tiempo y evolucionar independientemente unas de otras. Un ejemplo de esto es la conocida mutación de la proteína pico N501Y Aumento de la afinidad Del virus a nuestros receptores ACE2. N501Y se observó por primera vez en el genoma de la variante B.1.1.7 (Reino Unido), pero los científicos no tardaron en descubrir su presencia en las variantes B.1.351 (Sudáfrica) y P.1 (Brasil) como OK . Otra mutación proteica Vinculado al escape inmunológico, E484K, también ha adquirido una alta frecuencia mundial, apareciendo primero en B.1.351 y más recientemente en B.1.525, La última versión Para lavarse en las costas británicas.

Variables 677, según Estudio previo a la impresión Publicados la semana pasada, son similares en el sentido de que fueron detectados por primera vez en octubre por programas de vigilancia genética que están a casi mil millas de distancia. Se nombran debido a lo único que tienen en común: mutaciones en el sitio de 677 aminoácidos. En Luisiana, donde existe un programa para rastrearlo con éxito, los investigadores encontraron que la proporción de virus SARS-CoV-2 en la circulación doméstica que llevan la mutación Q677P aumentó de cero a casi un tercio (28 por ciento) entre principios de diciembre de 2020 y finales de enero de 2021. Al mismo tiempo, en el marco temporal, la prevalencia del auge en Nuevo México, donde se encuentra el otro programa, se ha elevado a poco más del 11 por ciento.

Los investigadores estaban tan fascinados con la afinidad alrededor del sitio 677 que decidieron buscar otras 677 mutaciones puntuales realizando un análisis genético de los datos genómicos disponibles (Figura 1). Una mutación, Q77H, apareció en seis cepas distintas de agosto a noviembre de 2020. Aunque cuatro de las seis cepas se confirmaron en solo unos 100 casos de Covid-19 o menos, la mutación restante apareció con mucha más frecuencia, una con casi 300 casos. El otro está cerca de 800. Estas cifras pueden parecer leves en comparación con los 28 millones de casos reportados hasta ahora en los EE.UU .. Dada la relativa escasez de esfuerzos de secuenciación en los EE.UU., indican el potencial de una mayor propagación.

Tengo Escribió previamente Acerca de una variable de rápida propagación en Columbus, Ohio que contiene la mutación Q77H, aunque en ese caso particular, se dice que la variante B.1.1.7 del Reino Unido se convierte en el lugar predominante en marzo o abril, a mi Dr. Bruce Vanderhoof, director médico. B.1.525 variable emergente, que contiene Ha sido reconocido En Nigeria, Dinamarca, el Reino Unido y muchos otros países, también porta la mutación Q77H, por lo que es la única alternativa internacional para hacerlo. Pero entonces, 677 mutaciones están notablemente ausentes de todas las variantes que se han vuelto frecuentes en todo el mundo hasta ahora, y aparecen casi exclusivamente en linajes que se originan en los Estados Unidos.

Aunque no se han observado mutaciones en el sitio 677 en la mayoría de las nuevas variantes esparcidas por Europa, América del Sur y otros lugares, otras también caen en la zona gris entre los dominios de unión al receptor y de fusión de péptidos. Por ejemplo, la variante B.1.1.7 (Reino Unido) tiene la mutación P681H a unos pocos aminoácidos de distancia, mientras que la variante de visón que circula en Dinamarca tiene la mutación I692V en un rango cercano similar (Figura 2). El sitio 677 tampoco está lejos del sitio de escisión del furano, que se encuentra entre las proteínas S1 y S2 en los aminoácidos 685 a 686. He especulado en mi nuevo libro Variables! El sitio de escisión de furina adicional, que decora la superficie del virus con uñas listas para soltar, es una de las razones por las que el SARS-CoV-2 es tan contagioso. Puede darse el caso de que 677 mutaciones mejoren este mecanismo, similar a agregar un gatillo a una pistola prefabricada, pero se necesita más investigación antes de poder decir esto con certeza.

En mi próximo artículo, exploraré por qué las nuevas variantes representan una oportunidad para que Estados Unidos reevalúe y actualice sus protocolos de salud pública. Más que simplemente prevenir lo peor, estas medidas serán un paso hacia un nivel de preparación para una pandemia que nos protegerá del futuro brote de Covid-19 y de cualquier otra enfermedad por venir, sin importar cuán diversas sean.