Los científicos han encontrado una estructura proteica sin precedentes en el virus

Al analizar las imágenes capturadas y las secuencias de genes de la proteína, los investigadores también pueden clasificar la proteína como una proteína similar a un grupo de enzimas metabolizadoras de carbohidratos llamadas glicosil hidrolasa GH45. Sin embargo, las similitudes entre la quitosanasa y la GH45 han sido limitadas. Las piezas que no se parecían a la enzima de la familia GH45 tampoco se parecían a ninguna otra enzima vista antes.

Smith agregó: «Hay una parte completamente nueva de la enzima. Eso es lo que me emociona como biólogo estructural: ver algo que no hemos visto antes y luego tratar de descubrir su papel». Presione soltar.

Esto abre más vías de investigación para determinar cómo funciona la proteína y su papel potencial en el ciclo del suelo. También ayudará a explorar el papel de los AMG y el papel que desempeñan en las interacciones con otros organismos del suelo.

Los resultados de la investigación fueron publicados en la revista Comunicaciones de la naturaleza.

Resumen

La metagenómica está descubriendo el reino previamente oculto de los virus del suelo. Varias secuencias virales del suelo en el metagenoma contienen genes metabólicos auxiliares putativos (AMG) que no están asociados con la replicación viral. Aquí, demostramos que los AMG presentes en los virus del suelo producen proteínas potentes y funcionales. Nos enfocamos en los AMG que probablemente codifican enzimas de quitosanasa que metabolizan la quitina, un polímero de carbono común. Expresamos varios genes de quitosanasa que se identificaron a partir de la metagenómica ambiental y se examinaron funcionalmente. Una única proteína expresada que exhibe actividad de endoquitosanasa (V-Csn) cristalizada y estructuralmente distinta a una resolución muy alta, lo que representa la estructura del producto AMG viral del suelo. Esta estructura proporciona detalles sobre el sitio activo y, con los modelos de estructura definidos mediante AlphaFold, es más fácil comprender la especificidad del sustrato y el mecanismo de la enzima. Nuestros hallazgos respaldan la hipótesis de que los virus del suelo contribuyen a las funciones auxiliares de sus huéspedes.